W pierwszej kolejności przyjmowani są pacjenci w stanie zagrożenia życia, pacjenci po przeszczepach do Oddziału Transplantacyjnego, oraz dzieci od 16 do 18 roku życia do Oddziału Wrodzonych Wad Serca i Kardiologii Dziecięcej.
Przyjęcia dzieci do 16 roku życia odbywają się bezpośrednio w Oddziale Wrodzonych Wad Serca i Kardiologii Dziecięcej.
Pozostałe przyjęcia planowe odbywają się zgodnie z kolejką pacjentów oczekujących na przyjęcie do SCCS.